15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2274 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2274  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  394  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000533455  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1305  hypothetical protein  94.25 
 
 		 175 aa  346  9e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.582103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0345  hypothetical protein  62.5 
 
 		 199 aa  250  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2879  hypothetical protein  39.36 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3139  hypothetical protein  40.72 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4691  hypothetical protein  33.15 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4784  hypothetical protein  32.04 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1160  hypothetical protein  24.07 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763364  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0185  hypothetical protein  28.36 
 
 		 402 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3695  hypothetical protein  23.9 
 
 		 361 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2353  hypothetical protein  26.61 
 
 		 296 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1623  hypothetical protein  24.86 
 
 		 304 aa  44.7  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1641  hypothetical protein  25.44 
 
 		 388 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3666  hypothetical protein  27.82 
 
 		 413 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  22.73 
 
 		 274 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>