75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1638 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1638  Ail/Lom family protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2110  virulence-related outer membrane protein  95.98 
 
 
199 aa  400  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1475  Ail/Lom family protein  92.96 
 
 
199 aa  390  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0914  Ail/Lom family protein  93.97 
 
 
199 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5541  Ail/Lom family protein  92.46 
 
 
199 aa  380  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2872  Ail/Lom family protein  92.46 
 
 
199 aa  380  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.015622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2761  Ail/Lom family protein  92.46 
 
 
199 aa  380  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.308137  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1639  Ail/Lom family protein  92.96 
 
 
199 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2231  Ail/Lom family protein  92.96 
 
 
199 aa  381  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102188 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2166  Ail/Lom family protein  92.96 
 
 
199 aa  381  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469806  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1202  Ail/Lom family protein  91.96 
 
 
199 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1204  Ail/Lom family protein  88.94 
 
 
199 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0613402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3187  Ail/Lom family protein  90.45 
 
 
199 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1879  Ail/Lom family protein  90.45 
 
 
199 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0581032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3119  Ail/Lom family protein  90.45 
 
 
199 aa  363  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.116259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0879  Ail/Lom family protein  88.94 
 
 
199 aa  362  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1803  Ail/Lom family protein  86.93 
 
 
199 aa  353  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.021538 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1095  putative Ail/Lom protein  100 
 
 
84 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00751  hypothetical protein  44.44 
 
 
206 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10055  outer host membrane  44.44 
 
 
206 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1282  putative entero Ail/Lom protein  97.53 
 
 
81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3500  outer membrane protein Lom  41.98 
 
 
244 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.755187  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3136  virulence-related outer membrane protein  37.2 
 
 
187 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4206  virulence-related outer membrane protein  33.67 
 
 
182 aa  99  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2120  virulence membrane protein PagC  34.71 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1349  virulence membrane protein PagC  32.64 
 
 
185 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0661499 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1363  virulence membrane protein PagC  32.64 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232924  normal  0.546382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4489  virulence-related outer membrane protein  33.84 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1936  virulence membrane protein PagC  34.71 
 
 
185 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1333  outer membrane invasion protein  34.71 
 
 
185 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1484  outer membrane protein X  32.84 
 
 
172 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1588  outer membrane protein X  32.67 
 
 
171 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000727095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1606  outer membrane protein X  33.01 
 
 
174 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0413281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1767  outer membrane protein X  33.01 
 
 
174 aa  92.8  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237049  normal  0.012422 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1501  outer membrane protein X  33.01 
 
 
174 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.02654e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0929  outer membrane protein X  34.8 
 
 
171 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2389  outer membrane protein X  36.76 
 
 
171 aa  91.7  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0962  outer membrane protein X  33.17 
 
 
171 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0983  outer membrane protein X  33.17 
 
 
171 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0899  outer membrane protein X  33.17 
 
 
171 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0871  outer membrane protein X  33.17 
 
 
171 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.676559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0871  outer membrane protein X  32.67 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00356643  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0884  outer membrane protein X  32.67 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00860999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00798  hypothetical protein  32.67 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0963  outer membrane protein X  32.67 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00475804  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2828  virulence-related outer membrane protein  32.67 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.166158  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2829  outer membrane protein X  32.67 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0838  outer membrane protein X  32.67 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202918  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2534  outer membrane protein X  32.67 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0526917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00781  outer membrane protein X  32.67 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2061  virulence-related outer membrane protein  33.52 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.906515  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1951  Ail/Lom family protein  33.52 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2874  outer membrane protein X  31.84 
 
 
171 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2360  virulence-related outer membrane protein  29.61 
 
 
183 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2485  outer membrane protein X  35.15 
 
 
170 aa  89  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.114339  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2152  attachment invasion locus protein precursor  32.96 
 
 
179 aa  87  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.224676  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2048  attachment invasion locus protein  30.24 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0054596  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2257  Ail/Lom family protein  28.64 
 
 
183 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00208525  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3366  outer membrane protein  29.81 
 
 
178 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.617319  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3201  outer membrane protein  29.33 
 
 
178 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3265  outer membrane protein  29.81 
 
 
178 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.45758 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1160  attachment invasion locus protein  30.46 
 
 
179 aa  85.1  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.92969e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3187  outer membrane protein  29.33 
 
 
178 aa  84.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0444  attachment invasion locus protein  29.95 
 
 
179 aa  84.7  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000196272  hitchhiker  0.00000073955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3250  outer membrane protein  29.33 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0628701  normal  0.157037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1301  outer membrane protein X  31.34 
 
 
172 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0373252  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1268  virulence-related outer membrane protein  30.35 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4278  outer membrane invasion protein  31.25 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0643904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0399  attachment invasion locus protein  35.39 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0017153  hitchhiker  0.0000619073 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0386  attachment invasion locus protein  35.39 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0188056  hitchhiker  0.00070272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0379  attachment invasion locus protein  35.39 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00107279  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0377  attachment invasion locus protein  35.39 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.857663  hitchhiker  0.00813108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0439  attachment invasion locus protein  34.27 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000617037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1153  attachment/invasion protein  29.95 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1418  attachment/invasion protein  30.77 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0141818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>