62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1282 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1282  putative entero Ail/Lom protein  100 
 
 		 81 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1639  Ail/Lom family protein  98.77 
 
 		 199 aa  164  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1204  Ail/Lom family protein  97.53 
 
 		 199 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0613402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5541  Ail/Lom family protein  97.53 
 
 		 199 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2872  Ail/Lom family protein  97.53 
 
 		 199 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.015622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2761  Ail/Lom family protein  97.53 
 
 		 199 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.308137  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2231  Ail/Lom family protein  97.53 
 
 		 199 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102188 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1638  Ail/Lom family protein  97.53 
 
 		 199 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2166  Ail/Lom family protein  97.53 
 
 		 199 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1095  putative Ail/Lom protein  97.53 
 
 		 84 aa  161  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1202  Ail/Lom family protein  96.3 
 
 		 199 aa  160  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3119  Ail/Lom family protein  96.3 
 
 		 199 aa  160  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.116259 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2110  virulence-related outer membrane protein  92.59 
 
 		 199 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1879  Ail/Lom family protein  93.83 
 
 		 199 aa  157  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0581032 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0879  Ail/Lom family protein  91.36 
 
 		 199 aa  157  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3187  Ail/Lom family protein  93.83 
 
 		 199 aa  157  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000477 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1475  Ail/Lom family protein  91.36 
 
 		 199 aa  157  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1803  Ail/Lom family protein  88.89 
 
 		 199 aa  153  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.021538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0914  Ail/Lom family protein  90.12 
 
 		 199 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00751  hypothetical protein  54.32 
 
 		 206 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10055  outer host membrane  54.32 
 
 		 206 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782687  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3500  outer membrane protein Lom  46.91 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.755187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1349  virulence membrane protein PagC  52.27 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0661499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2120  virulence membrane protein PagC  39.71 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1936  virulence membrane protein PagC  39.71 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1333  outer membrane invasion protein  39.71 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1363  virulence membrane protein PagC  52.27 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232924  normal  0.546382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1951  Ail/Lom family protein  37.66 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2061  virulence-related outer membrane protein  37.66 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.906515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4206  virulence-related outer membrane protein  45.1 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3136  virulence-related outer membrane protein  44.26 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2152  attachment invasion locus protein precursor  36.36 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.224676  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4489  virulence-related outer membrane protein  46.67 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1268  virulence-related outer membrane protein  38.71 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113528  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1160  attachment invasion locus protein  38.71 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.92969e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0444  attachment invasion locus protein  45.65 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000196272  hitchhiker  0.00000073955 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2360  virulence-related outer membrane protein  37.5 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2048  attachment invasion locus protein  37.5 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0054596  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1588  outer membrane protein X  35.59 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000727095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2874  outer membrane protein X  37.88 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2257  Ail/Lom family protein  35.42 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00208525  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0929  outer membrane protein X  50 
 
 		 171 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1301  outer membrane protein X  43.48 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0373252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2389  outer membrane protein X  42.59 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2829  outer membrane protein X  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2828  virulence-related outer membrane protein  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.166158  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00798  hypothetical protein  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0871  outer membrane protein X  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00356643  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0884  outer membrane protein X  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00860999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0963  outer membrane protein X  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00475804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0871  outer membrane protein X  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.676559  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0983  outer membrane protein X  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0962  outer membrane protein X  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00781  outer membrane protein X  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0899  outer membrane protein X  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2534  outer membrane protein X  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0526917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0838  outer membrane protein X  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0439  attachment invasion locus protein  35.71 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000617037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1484  outer membrane protein X  40.74 
 
 		 172 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1767  outer membrane protein X  39.22 
 
 		 174 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237049  normal  0.012422 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1501  outer membrane protein X  39.22 
 
 		 174 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.02654e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1606  outer membrane protein X  39.22 
 
 		 174 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0413281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>