28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3650 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3650  Domain of unknown function DUF1813 HSP20-like protein  100 
 
 		 113 aa  234  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5858  endoribonuclease SymE  93.81 
 
 		 113 aa  221  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.674922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4889  endoribonuclease SymE  93.81 
 
 		 132 aa  221  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.851109  normal  0.886905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04213  hypothetical protein  93.81 
 
 		 113 aa  220  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3720  endoribonuclease SymE  93.81 
 
 		 113 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4929  endoribonuclease SymE  79.09 
 
 		 110 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4879  endoribonuclease SymE  71.56 
 
 		 106 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0067  hypothetical protein  42.45 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0319  hypothetical protein  53.7 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695  normal  0.246915 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0325  hypothetical protein  49.12 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2815  hypothetical protein  37.04 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0318  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0354  hypothetical protein  36.46 
 
 		 103 aa  50.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0336  hypothetical protein  42.59 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0444  hypothetical protein  37.66 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1921  hypothetical protein  43.75 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03337  transposase  43.75 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2432  hypothetical protein  34.57 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3210  hypothetical protein  39.06 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1915  hypothetical protein  43.75 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01803  hypothetical protein  40.74 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.124801  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1158  hypothetical protein  36.99 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0309  hypothetical protein  41.67 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1999  hypothetical protein  41.67 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1990  hypothetical protein  48.48 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1927  hypothetical protein  48.48 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0605434  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02631  IS1595 transposase  39.22 
 
 		 260 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2010  hypothetical protein  48.48 
 
 		 70 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>