20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3519 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3519  large subunit terminase  100 
 
 		 568 aa  1201    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918493  hitchhiker  0.00317443 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  44.62 
 
 		 527 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  43.04 
 
 		 539 aa  243  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  41.58 
 
 		 523 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  38.41 
 
 		 504 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  27.22 
 
 		 496 aa  164  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2187  terminase large subunit  44.1 
 
 		 194 aa  160  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.479041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0854  hypothetical protein  45.66 
 
 		 229 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0386  hypothetical protein  35.18 
 
 		 543 aa  150  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2829  hypothetical protein  25.93 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  26.85 
 
 		 477 aa  134  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  27.05 
 
 		 477 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1310  hypothetical protein  26.08 
 
 		 522 aa  127  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0537638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1245  hypothetical protein  25.52 
 
 		 530 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0027528  normal  0.060022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1291  hypothetical protein  25.29 
 
 		 525 aa  124  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0834175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3729  hypothetical protein  23.84 
 
 		 525 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  24.95 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  25.05 
 
 		 526 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2189  hypothetical protein  34.21 
 
 		 324 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.580181 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4168  hypothetical protein  23.26 
 
 		 612 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0632962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>