25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00846 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  74.31 
 
 		 147 aa  215  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  72.92 
 
 		 147 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.728872 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  67.36 
 
 		 146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2760  tail assembly chaperone gp38  57.34 
 
 		 139 aa  151  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000085866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  49.29 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2490  tail assembly chaperone gp38  43.57 
 
 		 210 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0688487  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2471  tail fiber assembly protein  50.48 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  35.21 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  30.56 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  37.84 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  31.37 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  30.72 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  33.75 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  33.75 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  33.75 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  32.5 
 
 		 200 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  32.5 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  32.5 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0692  hypothetical protein  29.35 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  32.5 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  33.68 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  24.68 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  30.65 
 
 		 198 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>