More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2956 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008741  Dvul_2956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
272 aa  558  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.79 
 
 
272 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  32.95 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.17 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  32.43 
 
 
323 aa  125  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  30.71 
 
 
323 aa  124  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.35 
 
 
309 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.24 
 
 
392 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.3 
 
 
303 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31920  chromosome segregation ATPase  32.58 
 
 
293 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  34.36 
 
 
258 aa  122  8e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  34.11 
 
 
370 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.78 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  32.31 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.36 
 
 
258 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.95 
 
 
295 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  31.58 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  30.2 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.21 
 
 
298 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  32.3 
 
 
308 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  33.2 
 
 
332 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  29.39 
 
 
258 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
253 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  31.54 
 
 
305 aa  118  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  33.21 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  33.85 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
410 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.66 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  30.98 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.38 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.06 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.92 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  30.53 
 
 
256 aa  115  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.8 
 
 
270 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  30.3 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.3 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.3 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  30.3 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.3 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.68 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.3 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.3 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.92 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.3 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.3 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  31.03 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.92 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  30.62 
 
 
315 aa  113  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.01 
 
 
257 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.95 
 
 
302 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
253 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.08 
 
 
452 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.76 
 
 
268 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.06 
 
 
302 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  32.55 
 
 
345 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  32.46 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.78 
 
 
276 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.21 
 
 
329 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 
307 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  31.5 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.31 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  31.5 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.42 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  31.27 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.5 
 
 
336 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  30.89 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
462 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
254 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
262 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  31.1 
 
 
260 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  31.5 
 
 
333 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 
260 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.62 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.2 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  30.77 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.17 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  32.03 
 
 
341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  32.18 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.74 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  30.12 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
262 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3720  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.8 
 
 
416 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000821515  hitchhiker  0.000233932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  29.92 
 
 
257 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  29.92 
 
 
257 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.27 
 
 
284 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.91 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  29.45 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  30.62 
 
 
260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  30.77 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>