13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1033 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1033  fimbrial assembly membrane protein, putative  100 
 
 
193 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3026  Pilus assembly protein PilO  25 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  23.2 
 
 
203 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5130  type IV pilus biogenesis protein PilO  25.26 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.818389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  25.26 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02353  fimbrial assembly membrane protein  24.43 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0610  pilus assembly protein, PilO  21.31 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12175  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1858  fimbrial assembly membrane protein  23.76 
 
 
222 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0178525  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1787  pilus assembly protein PilO  23.76 
 
 
222 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.521607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0407  pilus assembly protein, PilO  22.04 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0292492  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  23 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1939  Pilus assembly protein PilO  21.11 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0541  hypothetical protein  22.22 
 
 
264 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>