39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3518 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  79.11 
 
 		 502 aa  778    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  73.1 
 
 		 508 aa  710    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  69.6 
 
 		 513 aa  696    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  69.42 
 
 		 528 aa  734    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  72.24 
 
 		 508 aa  707    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  72.27 
 
 		 516 aa  691    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  73.83 
 
 		 509 aa  697    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  72.65 
 
 		 508 aa  710    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  100 
 
 		 534 aa  1090    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  71.14 
 
 		 512 aa  694    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  78.76 
 
 		 500 aa  757    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  79.11 
 
 		 502 aa  776    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2979  chlorophyllide reductase subunit Y  75.22 
 
 		 468 aa  681    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.927182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  70.67 
 
 		 533 aa  739    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  81.31 
 
 		 521 aa  851    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  73.1 
 
 		 535 aa  734    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  68.67 
 
 		 540 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1609  chlorophyllide reductase subunit Y  70.37 
 
 		 455 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  37 
 
 		 422 aa  264  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  34.46 
 
 		 412 aa  260  4e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  32.85 
 
 		 422 aa  253  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  37.92 
 
 		 438 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  34.15 
 
 		 412 aa  249  7e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  34.38 
 
 		 418 aa  249  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  36.77 
 
 		 422 aa  247  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  34.22 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  33.17 
 
 		 411 aa  243  7.999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  31.87 
 
 		 415 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.77 
 
 		 468 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.14 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.75 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.63 
 
 		 466 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.63 
 
 		 466 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.58 
 
 		 424 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.3 
 
 		 466 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.5 
 
 		 418 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  22.58 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.63 
 
 		 422 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.07 
 
 		 420 aa  43.5  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>