20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0501 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0501  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0386  hypothetical protein  39.32 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5275  hypothetical protein  42.76 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0418  hypothetical protein  39.5 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.89745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3084  hypothetical protein  45.6 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  42.18 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3200  hypothetical protein  35.2 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  31.05 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  35.21 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3123  hypothetical protein  38.02 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120725  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  31.07 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  27.91 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  29.59 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  29.22 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  29.08 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  29.08 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  27.92 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0398  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  34.31 
 
 		 335 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  31.3 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>