25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2557 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2557  dehydrogenase (flavoproteins)  100 
 
 		 371 aa  770    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2949  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  45.98 
 
 		 356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0218  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  44.9 
 
 		 366 aa  319  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0169  dehydrogenase (flavoproteins)  41.6 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0219  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  39.65 
 
 		 355 aa  291  9e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1245  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 		 350 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0173  dehydrogenase (flavoproteins)  37.91 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3923  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  36.69 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3414  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  32.58 
 
 		 355 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0661  FAD dependent dehydrogenase  28.86 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3408  hypothetical protein  33.08 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0688  FAD dependent dehydrogenase  22.38 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  22.73 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  29.46 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  51.35 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  22.73 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  24.18 
 
 		 372 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  36.99 
 
 		 470 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  38.71 
 
 		 938 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  20.52 
 
 		 406 aa  43.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.28 
 
 		 453 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  51.28 
 
 		 473 aa  42.7  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  51.28 
 
 		 473 aa  42.7  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>