66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2325 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0801  hypothetical protein  65.8 
 
 
536 aa  754    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79707  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2325  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
537 aa  1129    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1045  glycoside hydrolase family protein  60.61 
 
 
529 aa  671    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0429  hypothetical protein  61.32 
 
 
528 aa  640    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1915  glycoside hydrolase family protein  59.36 
 
 
528 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0191786  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1076  glycoside hydrolase family protein  56.23 
 
 
531 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1135  hypothetical protein  56.23 
 
 
531 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1204  hypothetical protein  56.23 
 
 
531 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.117287  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0047  hypothetical protein  54.37 
 
 
537 aa  625  1e-178  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.666843  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2006  Domain of unknown function DUF1957  55.79 
 
 
528 aa  622  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1115  hypothetical protein  55.11 
 
 
532 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.096996  normal  0.0392314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  55.11 
 
 
542 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0045  glycoside hydrolase family protein  54.06 
 
 
527 aa  578  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5064  hypothetical protein  53.88 
 
 
529 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224358 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1889  hypothetical protein  52.91 
 
 
531 aa  562  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.804439 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1332  hypothetical protein  52.45 
 
 
539 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0382  glycoside hydrolase family protein  54.06 
 
 
529 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3806  hypothetical protein  53.31 
 
 
529 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1304  hypothetical protein  52.45 
 
 
539 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  51.59 
 
 
534 aa  557  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0867  hypothetical protein  51.32 
 
 
533 aa  548  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0560  glycoside hydrolase family 57  50.39 
 
 
513 aa  546  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  52.1 
 
 
935 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1983  hypothetical protein  52.93 
 
 
529 aa  542  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0294  hypothetical protein  50 
 
 
524 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1356  hypothetical protein  49.14 
 
 
528 aa  508  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000931698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1330  glycoside hydrolase family protein  49.14 
 
 
528 aa  509  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00276943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1854  glycoside hydrolase family protein  50.47 
 
 
582 aa  505  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0306  hypothetical protein  48.58 
 
 
528 aa  508  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0099  glycoside hydrolase family protein  51.04 
 
 
533 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0588  hypothetical protein  46.5 
 
 
538 aa  506  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0687  hypothetical protein  43.13 
 
 
521 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.034103  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15211  hypothetical protein  42.67 
 
 
521 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.270721  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1940  hypothetical protein  40.55 
 
 
531 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0726  hypothetical protein  39.85 
 
 
527 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11251  hypothetical protein  41.95 
 
 
520 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.448443  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11701  hypothetical protein  40.49 
 
 
527 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208787  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11711  hypothetical protein  40.93 
 
 
527 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1076  hypothetical protein  40.71 
 
 
527 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09171  hypothetical protein  41.5 
 
 
522 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127848 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11551  hypothetical protein  40.34 
 
 
527 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0895  glycoside hydrolase family 57  32.79 
 
 
520 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4461  hypothetical protein  33.61 
 
 
649 aa  268  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.608634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0433  glycoside hydrolase family 57  33.77 
 
 
514 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.188798  hitchhiker  0.0014488 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1094  hypothetical protein  28.82 
 
 
525 aa  243  7e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1501  hypothetical protein  29.89 
 
 
520 aa  206  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.53215  normal  0.500126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3262  hypothetical protein  26.74 
 
 
522 aa  206  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6057  glycoside hydrolase family 57  31.78 
 
 
499 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3734  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 
511 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28290  hypothetical protein  30.29 
 
 
505 aa  199  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.964818  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2919  glycoside hydrolase family 57  28.63 
 
 
512 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2097  glycoside hydrolase family protein  28.14 
 
 
532 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1868  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 
521 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1914  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 
521 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0322006  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1848  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 
521 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13047  hypothetical protein  28.01 
 
 
526 aa  177  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4261  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 
531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4743  hypothetical protein  27.29 
 
 
478 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0114  hypothetical protein  26.3 
 
 
480 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.54756  normal  0.147271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4653  glycoside hydrolase family 57  27.07 
 
 
491 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  23.21 
 
 
361 aa  53.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  28.15 
 
 
726 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 
726 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  28.15 
 
 
726 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 
722 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  25.44 
 
 
743 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>