20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0853 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0853  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1413  hypothetical protein  53.88 
 
 
293 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0357  hypothetical protein  45.99 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000411599  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2265  hypothetical protein  44.7 
 
 
263 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1569  hypothetical protein  62.32 
 
 
82 aa  88.6  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000116147  normal  0.140316 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  26.27 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  29.52 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  25 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  27.49 
 
 
514 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  24.58 
 
 
502 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5793  hypothetical protein  26.91 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  1.8422799999999998e-21  hitchhiker  8.24928e-21 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5635  hypothetical protein  26.91 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272389  normal  0.403881 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  25.81 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  23.9 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  27.15 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  25.83 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06570  protein of unknown function (DUF955)  26.6 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.96837 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  25.43 
 
 
660 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  23.31 
 
 
344 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>