More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0647 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1140    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  41.27 
 
 		 563 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  41.73 
 
 		 561 aa  458  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  39.75 
 
 		 561 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  40.18 
 
 		 561 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  39.21 
 
 		 560 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  39.39 
 
 		 560 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  36.13 
 
 		 558 aa  395  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  37.79 
 
 		 558 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  38.14 
 
 		 557 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  36.84 
 
 		 564 aa  391  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  37.97 
 
 		 568 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.75 
 
 		 592 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.02 
 
 		 559 aa  382  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.5 
 
 		 558 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.21 
 
 		 561 aa  381  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.03 
 
 		 559 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.89 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  34.77 
 
 		 558 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.17 
 
 		 584 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.3 
 
 		 559 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  35.38 
 
 		 581 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  36.16 
 
 		 582 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  35.82 
 
 		 559 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  35.69 
 
 		 558 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  34.71 
 
 		 599 aa  363  5.0000000000000005e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  35.38 
 
 		 581 aa  363  6e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.59 
 
 		 558 aa  362  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.19 
 
 		 554 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.45 
 
 		 559 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  34.15 
 
 		 558 aa  356  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  34.66 
 
 		 560 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  36.52 
 
 		 591 aa  355  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  38.2 
 
 		 562 aa  354  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  35.65 
 
 		 555 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  36.06 
 
 		 582 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  35.6 
 
 		 582 aa  342  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  33.27 
 
 		 556 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  35.93 
 
 		 547 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  33.82 
 
 		 552 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  33.21 
 
 		 557 aa  325  9e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.7 
 
 		 555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  36.79 
 
 		 556 aa  312  9e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  36.9 
 
 		 557 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.37 
 
 		 573 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.45 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  36.27 
 
 		 557 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.06 
 
 		 557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  33.66 
 
 		 557 aa  303  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  33.7 
 
 		 559 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  33.94 
 
 		 543 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  33.94 
 
 		 556 aa  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  33.76 
 
 		 543 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  34.14 
 
 		 551 aa  297  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  31.15 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  33.21 
 
 		 565 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  33.21 
 
 		 565 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  33.15 
 
 		 544 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  31.15 
 
 		 537 aa  293  8e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  31.4 
 
 		 552 aa  290  6e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  35.31 
 
 		 560 aa  289  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  32.61 
 
 		 544 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  34.46 
 
 		 547 aa  282  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  35.22 
 
 		 544 aa  282  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  31.94 
 
 		 549 aa  280  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  32.41 
 
 		 606 aa  276  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.97 
 
 		 546 aa  272  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  35.4 
 
 		 560 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  33.08 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  32.67 
 
 		 547 aa  269  8e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  29.43 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.31 
 
 		 547 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.93 
 
 		 558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  35.24 
 
 		 550 aa  268  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.6 
 
 		 547 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  29.56 
 
 		 571 aa  266  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  34.72 
 
 		 542 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  31.01 
 
 		 586 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  32.49 
 
 		 563 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  29.03 
 
 		 549 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  30.75 
 
 		 549 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  30.93 
 
 		 561 aa  262  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.54 
 
 		 561 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  30.51 
 
 		 585 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  30.56 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  31.98 
 
 		 546 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.69 
 
 		 527 aa  260  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  32.02 
 
 		 582 aa  259  9e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.91 
 
 		 553 aa  259  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  31.98 
 
 		 561 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  31.98 
 
 		 584 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  30.02 
 
 		 550 aa  256  8e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  33.71 
 
 		 549 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.95 
 
 		 551 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  33.26 
 
 		 541 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  33.82 
 
 		 559 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.78 
 
 		 534 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2458  ABC-1 domain protein  32.47 
 
 		 551 aa  253  9.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.89 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.03 
 
 		 525 aa  252  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>