60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4895 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4895  microcompartments protein  100 
 
 		 182 aa  361  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3269  microcompartments protein  84.62 
 
 		 182 aa  276  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.942262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0360  microcompartments protein  51.4 
 
 		 181 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1303  microcompartments protein  53.41 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1916  microcompartments protein  46.33 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1371  microcompartments protein  46.96 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2231  polyhedral body protein  41.99 
 
 		 184 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2277  polyhedral body protein  41.44 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0109336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2390  polyhedral body protein  41.44 
 
 		 184 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2177  polyhedral body protein  40.88 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2224  polyhedral body protein  40.88 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0143783  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3265  putative propanediol utilization protein PduT  51.43 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0085  microcompartments protein  41.99 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1244  microcompartments protein  50.29 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2056  microcompartments protein  42.69 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1186  microcompartments protein  43.09 
 
 		 182 aa  140  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2295  propanediol utilization protein PduT  39.23 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0901  ethanolamine utilization protein  33.33 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2636  microcompartments protein  37.84 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1939  microcompartments protein  35.96 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5812  microcompartments protein  36.17 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3272  propanediol utilization protein (PduT)-like  35.5 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1366  microcompartments protein  36.81 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1425  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmO  30.89 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4467  microcompartments protein  31.77 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3284  carbon dioxide concentrating mechanism protein (PduA related)-like  34.62 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0785  microcompartments protein  29.89 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0812  microcompartments protein  29.89 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2748  microcompartments protein  31.52 
 
 		 271 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1860  microcompartments protein  30.89 
 
 		 262 aa  52.4  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.864195  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1359  microcompartments protein  39.29 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1355  microcompartments protein  32.62 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.431976  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  35.37 
 
 		 96 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3280  carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein-like  47.46 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  41.98 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1613  microcompartments protein  30.57 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  37.21 
 
 		 93 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3846  microcompartments protein  28.5 
 
 		 258 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0700872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4908  microcompartments protein  39.53 
 
 		 98 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2287  propanediol utilization protein PduK  37.5 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  31.71 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  30.49 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  31.71 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  31.71 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  30.49 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  39.24 
 
 		 100 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  30.49 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2345  microcompartments protein  41.49 
 
 		 106 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000506972  hitchhiker  0.00332823 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1182  microcompartments protein  35.96 
 
 		 164 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  30.49 
 
 		 113 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  30.49 
 
 		 102 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  37.5 
 
 		 96 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1291  microcompartments protein  40.24 
 
 		 92 aa  42  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0501  putative carboxysome structural-like protein  37.23 
 
 		 105 aa  41.6  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3286  microcompartments protein  38.37 
 
 		 99 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  36.59 
 
 		 96 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  30.49 
 
 		 102 aa  41.2  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  30.49 
 
 		 102 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1232  microcompartments protein  35.71 
 
 		 98 aa  40.8  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  29.27 
 
 		 103 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>