41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3988 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3988  VanZ family protein  100 
 
 
198 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.425328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2484  VanZ family protein  37.43 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000301645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2631  teicoplanin resistance protein VanZ  36.17 
 
 
210 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.47817  decreased coverage  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2680  teicoplanin resistance protein VanZ  36.7 
 
 
210 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  36.87 
 
 
210 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  35.39 
 
 
210 aa  99  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1049  vanZ protein, putative  35 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.621429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4297  hypothetical protein  35 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1046  hypothetical protein  34.39 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0067199999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0962  hypothetical protein  44.16 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0904  hypothetical protein  44.16 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0870  VanZ family protein  42.86 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3806  VanZ family protein  41.18 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0886  teicoplanin resistance protein vanZ  41.56 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0750721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0867  teicoplanin resistance protein  42.67 
 
 
211 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0490  VanZ family protein  34.55 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2680  VanZ family protein  47.44 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1911  hypothetical protein  31.06 
 
 
354 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5115  hypothetical protein  34.88 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2015  VanZ family protein  29.17 
 
 
185 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0179065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2187  VanZ family protein  32.17 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000988027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3164  VanZ family protein  32.98 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4846  hypothetical protein  32.56 
 
 
248 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5212  hypothetical protein  32.56 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3207  protein VanZ  31.29 
 
 
177 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5083  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1601  VanZ family protein  30.82 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0259  glycopeptide antibiotics resistance protein  37.66 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2373  VanZ family protein  27.33 
 
 
156 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.521595  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3474  VanZ family protein  29.2 
 
 
148 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000194917  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1302  VanZ family protein  37.8 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1340  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.28 
 
 
669 aa  48.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.774889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3291  VanZ family protein  32.97 
 
 
116 aa  48.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00099005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1004  teicoplanin resistance protein  56.76 
 
 
79 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0210  VanZ family protein  27.38 
 
 
387 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4512  VanZ family protein  36.51 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107268  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0459  VanZF domain-containing protein  28.97 
 
 
171 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08310  VanZ family protein  29.57 
 
 
149 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1054  glycopeptide antibiotics resistance protein  35.05 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0510  hypothetical protein  23.15 
 
 
132 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.501787 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C11  glycopeptide antibiotics resistance protein  32.99 
 
 
191 aa  41.6  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>