24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1302 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1302  VanZ family protein  100 
 
 
203 aa  412  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1049  vanZ protein, putative  35.87 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.621429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4297  hypothetical protein  36.96 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1046  hypothetical protein  35.87 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0067199999999997e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0886  teicoplanin resistance protein vanZ  35.87 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0750721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0904  hypothetical protein  36.96 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0962  hypothetical protein  36.96 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0870  VanZ family protein  35.87 
 
 
208 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0867  teicoplanin resistance protein  41.33 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2484  VanZ family protein  36.62 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000301645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2631  teicoplanin resistance protein VanZ  32.65 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.47817  decreased coverage  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  36.23 
 
 
210 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0459  VanZF domain-containing protein  33.93 
 
 
171 aa  48.5  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2680  teicoplanin resistance protein VanZ  33.33 
 
 
210 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2187  VanZ family protein  28.57 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000988027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3207  protein VanZ  29.25 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  37.68 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1340  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.49 
 
 
669 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.774889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3806  VanZ family protein  33.33 
 
 
172 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1841  VanZ family protein  28.78 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14560  glycopeptide antibiotics resistance protein  42.42 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.938726  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0490  VanZ family protein  31.47 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1911  hypothetical protein  35.8 
 
 
354 aa  42.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3988  VanZ family protein  43.14 
 
 
198 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.425328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>