18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2700 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2700  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  276  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2713  hypothetical protein  60.61 
 
 
70 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0487046  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0067  hypothetical protein  23.46 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0521488 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  25.89 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  24.19 
 
 
278 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  28.75 
 
 
963 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  38.46 
 
 
1246 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  23.66 
 
 
212 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  21.98 
 
 
209 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  25.56 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  20.39 
 
 
243 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  25 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  19.54 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4157  hypothetical protein  24.21 
 
 
201 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0018779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  19.83 
 
 
526 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1517  hypothetical protein  26.03 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  22.9 
 
 
403 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  22.9 
 
 
403 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>