53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0763 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  43.23 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  31.58 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  41.73 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  30.92 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  33.1 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  40.8 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  38.41 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  38.41 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  37.24 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  35.66 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  36.96 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  35.42 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  29.37 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  30.99 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  30.14 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  32.19 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  25.3 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  29.61 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 300 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 300 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 300 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  27.08 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  32.65 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 300 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  26.04 
 
 		 177 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 300 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  28.29 
 
 		 156 aa  50.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 		 300 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 300 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  28.29 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  28.36 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  26.75 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 300 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  28 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  26.75 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  26.45 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  26.75 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  28.08 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  26.75 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  26.75 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  24.6 
 
 		 300 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  25.81 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  24.03 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  24.03 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  25 
 
 		 146 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  26.62 
 
 		 155 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  23.65 
 
 		 155 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>