13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0234 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0234  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  255  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000287276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  50 
 
 
812 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  60.87 
 
 
617 aa  55.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2400  hypothetical protein  45.1 
 
 
611 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0223  hypothetical protein  66.67 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  32.61 
 
 
1000 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3267  hypothetical protein  33.85 
 
 
537 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2447  hypothetical protein  41.3 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  34.69 
 
 
457 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0776  hypothetical protein  45.24 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  29.23 
 
 
740 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  28.26 
 
 
590 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.43 
 
 
14916 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>