27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2439 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2439  membrane protein-like  100 
 
 		 317 aa  606  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  28.98 
 
 		 589 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  35.2 
 
 		 672 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  30.07 
 
 		 595 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  32.96 
 
 		 678 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  28.43 
 
 		 576 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  36.12 
 
 		 651 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  34.98 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  30.66 
 
 		 596 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  27.59 
 
 		 571 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  27.59 
 
 		 563 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2535  hypothetical protein  25.75 
 
 		 554 aa  53.1  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  34 
 
 		 659 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  30 
 
 		 603 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  30 
 
 		 603 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  30.4 
 
 		 608 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  31.71 
 
 		 602 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  28.57 
 
 		 603 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  29.36 
 
 		 596 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  29.36 
 
 		 590 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  31.71 
 
 		 602 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  31.71 
 
 		 602 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  31.22 
 
 		 602 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  31.22 
 
 		 602 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  31.22 
 
 		 602 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  31.92 
 
 		 568 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>