26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1677 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
563 aa  1109    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  28.57 
 
 
347 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1850  PRC-barrel domain-containing protein  39.1 
 
 
159 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  27.96 
 
 
301 aa  98.2  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3197  PRC-barrel domain-containing protein  29.38 
 
 
184 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0772217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1649  hypothetical protein  34.18 
 
 
152 aa  88.2  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0145454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  29.41 
 
 
220 aa  86.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0459  hypothetical protein  25.75 
 
 
268 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1194  PRC-barrel domain protein  25.88 
 
 
178 aa  84  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3262  PRC-barrel domain-containing protein  31.41 
 
 
230 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2494  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 
157 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0207  hypothetical protein  21.46 
 
 
248 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3578  hypothetical protein  29.07 
 
 
164 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0227988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0957  PRC-barrel domain protein  34.56 
 
 
157 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3233  hypothetical protein  21.12 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05720  PRC-barrel domain protein  27.61 
 
 
161 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.443895  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0886  hypothetical protein  23.44 
 
 
259 aa  67  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3061  hypothetical protein  23.91 
 
 
268 aa  65.1  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.488038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2564  hypothetical protein  21.83 
 
 
274 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2589  hypothetical protein  32.54 
 
 
143 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000783955  hitchhiker  0.00142136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0398  hypothetical protein  27.04 
 
 
349 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0002  hypothetical protein  29.51 
 
 
290 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106351  normal  0.0651956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1416  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0532  hypothetical protein  22.78 
 
 
286 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.38672  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2256  hypothetical protein  25.83 
 
 
361 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0424  hypothetical protein  25.83 
 
 
360 aa  43.9  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.668376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>