20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1054 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1054  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  291  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.657724  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0865  hypothetical protein  36.51 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149678  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3314  hypothetical protein  36.84 
 
 		 346 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2221  hypothetical protein  34.55 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.853189  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5647  hypothetical protein  34.21 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2574  hypothetical protein  28.8 
 
 		 300 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0172  hypothetical protein  35.9 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1933  hypothetical protein  30.95 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6583  hypothetical protein  34.19 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0442  hypothetical protein  28.69 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.773186  normal  0.498356 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32780  predicted protein  34.15 
 
 		 422 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1963  hypothetical protein  32.17 
 
 		 317 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.435918  normal  0.990238 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10123  conserved hypothetical protein  31.09 
 
 		 433 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3455  hypothetical protein  32.17 
 
 		 338 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5963  hypothetical protein  30.63 
 
 		 356 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0133958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3609  hypothetical protein  32.67 
 
 		 351 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5139  hypothetical protein  26.67 
 
 		 298 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2373  hypothetical protein  34.13 
 
 		 277 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.780388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4811  hypothetical protein  34.48 
 
 		 509 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02881  conserved hypothetical protein  27.84 
 
 		 441 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.406918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>