More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0063 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2299  amidophosphoribosyltransferase  68.1 
 
 
465 aa  646    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
472 aa  968    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1052  amidophosphoribosyltransferase  69.76 
 
 
491 aa  662    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  55.77 
 
 
472 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  55.41 
 
 
469 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
488 aa  490  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
473 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  49.47 
 
 
468 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  51.29 
 
 
487 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  52 
 
 
494 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  49.06 
 
 
474 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  52 
 
 
494 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  51.91 
 
 
496 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  48.4 
 
 
475 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  50.53 
 
 
471 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
471 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
471 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
471 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
471 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
465 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
471 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
475 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  51.06 
 
 
471 aa  461  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  50.21 
 
 
471 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  50.53 
 
 
471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
478 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  49.79 
 
 
480 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  50.53 
 
 
471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
467 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  47.52 
 
 
477 aa  458  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  47.3 
 
 
477 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  50.42 
 
 
509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  50.74 
 
 
493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  50.65 
 
 
475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  51.54 
 
 
470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  49.48 
 
 
563 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  46.14 
 
 
474 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
466 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  51.32 
 
 
470 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  49.58 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  49.25 
 
 
499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
514 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
482 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
558 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  47.81 
 
 
474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0163  amidophosphoribosyltransferase  51.05 
 
 
526 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124827  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
503 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
472 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  50.21 
 
 
517 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
512 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  49.24 
 
 
466 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
491 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  47.5 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
493 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  47.96 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
491 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
495 aa  436  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  47.73 
 
 
472 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  47.52 
 
 
472 aa  436  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  48.38 
 
 
466 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  49.47 
 
 
491 aa  438  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
480 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
481 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
496 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
475 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
492 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
506 aa  436  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  47.01 
 
 
459 aa  435  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0154  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
526 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.66132  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
491 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 
514 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
503 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
451 aa  435  1e-120  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0094  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
544 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  49.79 
 
 
534 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  49.67 
 
 
503 aa  432  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  47.01 
 
 
466 aa  429  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  47.81 
 
 
505 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  48.38 
 
 
500 aa  430  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
484 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  49.15 
 
 
499 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
515 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  48.65 
 
 
514 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  48.99 
 
 
462 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  48.63 
 
 
517 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
462 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  49.79 
 
 
503 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  44.75 
 
 
470 aa  427  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18600  amidophosphoribosyltransferase  48.95 
 
 
537 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  47.2 
 
 
514 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  47.48 
 
 
493 aa  428  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  51.27 
 
 
501 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  49.57 
 
 
479 aa  428  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  48.83 
 
 
506 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>