23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5721 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5721  protein of unknown function DUF187  100 
 
 		 557 aa  1162    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.82272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  26.73 
 
 		 685 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  25.05 
 
 		 675 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  26.84 
 
 		 682 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3131  hypothetical protein  22.97 
 
 		 754 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618115  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  25.53 
 
 		 721 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  22.06 
 
 		 690 aa  114  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  23.42 
 
 		 702 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  21.29 
 
 		 705 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  21.09 
 
 		 744 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  20.8 
 
 		 704 aa  94.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1998  hypothetical protein  20.43 
 
 		 773 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0589983  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2232  hypothetical protein  22.27 
 
 		 770 aa  76.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0780  hypothetical protein  23.19 
 
 		 638 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.27648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  19.64 
 
 		 906 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  21.35 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  25.51 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1682  putative lipoprotein  22.01 
 
 		 404 aa  43.5  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2166  hypothetical protein  22.38 
 
 		 384 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2104  putative lipoprotein  22.38 
 
 		 404 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  22.38 
 
 		 439 aa  43.5  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  22.38 
 
 		 439 aa  43.5  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  22.38 
 
 		 439 aa  43.5  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>