More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5181 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5181  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  100 
 
 
470 aa  970    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.34284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1480  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  78.51 
 
 
470 aa  783    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311375  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4799  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.32 
 
 
469 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0439232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1676  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.32 
 
 
471 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.890585  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2279  6-phosphogluconate dehydrogenase  50 
 
 
471 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000283239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0326  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.57 
 
 
469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1215  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.04 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1694  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  47.66 
 
 
474 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0420  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.15 
 
 
471 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0828  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.15 
 
 
471 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0469  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.15 
 
 
471 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2515  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.15 
 
 
471 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1834  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.46 
 
 
473 aa  463  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0642  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.88 
 
 
472 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1798  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.15 
 
 
471 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0833  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  47 
 
 
490 aa  463  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2376  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.15 
 
 
471 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2061  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.76 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00146542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1582  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.38 
 
 
482 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0292783 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0631  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.87 
 
 
471 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.72 
 
 
473 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.627768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2258  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.72 
 
 
473 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1275  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  48.5 
 
 
476 aa  458  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.374225  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4676  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.49 
 
 
470 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0753605  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4715  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.73 
 
 
469 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246176  decreased coverage  0.00597476 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1204  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.97 
 
 
468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2527  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.07 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.585801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1608  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.19 
 
 
468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2847  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.75 
 
 
468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3801  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.49 
 
 
470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.835565 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3285  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.49 
 
 
470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.97 
 
 
468 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0166  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.91 
 
 
469 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.91 
 
 
469 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0157  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.57 
 
 
469 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2181  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.06 
 
 
470 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296225  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3014  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.52 
 
 
468 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000146076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0164  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.91 
 
 
469 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3620  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.06 
 
 
470 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2210  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.44 
 
 
469 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828318  normal  0.666462 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4459  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.06 
 
 
470 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0208  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.91 
 
 
469 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0186  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.91 
 
 
469 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1061  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  47.84 
 
 
477 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142467  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3907  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.06 
 
 
470 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5683  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  47.06 
 
 
479 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696376  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2811  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  47.64 
 
 
482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0443  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.37 
 
 
472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3177  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.79 
 
 
469 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.635161 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1601  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.08 
 
 
468 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0039  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.17 
 
 
471 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.554725  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1569  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.08 
 
 
468 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3297  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.5 
 
 
475 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2535  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.79 
 
 
469 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2436  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.79 
 
 
469 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2297  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  48.87 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0758  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.06 
 
 
501 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2183  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.54 
 
 
468 aa  438  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000119365  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5973  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.44 
 
 
469 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.882355 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01931  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.67 
 
 
468 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1628  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.45 
 
 
468 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00766748  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0339  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.14 
 
 
482 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00114124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1031  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.45 
 
 
468 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01917  hypothetical protein  45.67 
 
 
468 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1202  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.67 
 
 
468 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.141646  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2404  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.35 
 
 
484 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2625  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  47.8 
 
 
483 aa  428  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1613  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.02 
 
 
468 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2320  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.4 
 
 
468 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2642  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.89 
 
 
468 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02427  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.71 
 
 
482 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3505  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.18 
 
 
507 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0635  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.86 
 
 
484 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2962  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.24 
 
 
468 aa  430  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000250075 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  45.24 
 
 
475 aa  429  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2307  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.67 
 
 
468 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97354  hitchhiker  0.00484467 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03954  hypothetical protein similar to 6-phosphogluconate dehydrogenase (Eurofung)  47.16 
 
 
490 aa  427  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0543109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2206  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.45 
 
 
468 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.553067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2420  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.45 
 
 
468 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511918  hitchhiker  0.0040278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.45 
 
 
468 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00877145 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0397  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.24 
 
 
468 aa  425  1e-118  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0892  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  44.26 
 
 
477 aa  425  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.305911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2260  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.45 
 
 
468 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16410  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  46.34 
 
 
479 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1889  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.67 
 
 
483 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0324159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2599  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.02 
 
 
523 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003325  6-phosphogluconate dehydrogenase decarboxylating  45.49 
 
 
482 aa  425  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0139  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.2 
 
 
469 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00696747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1729  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.78 
 
 
484 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.235564  normal  0.119479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1950  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.83 
 
 
505 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0685  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.64 
 
 
482 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1766  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.1 
 
 
478 aa  419  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232976  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0197  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.82 
 
 
470 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2449  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  45.69 
 
 
478 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4083  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.06 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642645  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2752  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.99 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3598  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.59 
 
 
486 aa  415  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0497  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.72 
 
 
469 aa  412  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00911592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3824  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.49 
 
 
478 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.75231  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0340  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  44.89 
 
 
485 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>