254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5139 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
141 aa  289  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  65.15 
 
 
138 aa  189  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  60 
 
 
149 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  60.77 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  54.74 
 
 
145 aa  165  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  53.33 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  54.41 
 
 
141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  60 
 
 
148 aa  161  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  51.82 
 
 
140 aa  159  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  51.82 
 
 
140 aa  159  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  56.2 
 
 
140 aa  158  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  53.96 
 
 
144 aa  158  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  52.9 
 
 
145 aa  156  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  57.38 
 
 
172 aa  156  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  54.35 
 
 
142 aa  155  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  60 
 
 
147 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  53.6 
 
 
157 aa  154  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  53.6 
 
 
146 aa  154  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  55.88 
 
 
142 aa  154  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  54.74 
 
 
147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  54.74 
 
 
147 aa  153  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  56.67 
 
 
150 aa  153  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  52.55 
 
 
138 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  52.55 
 
 
138 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  52.55 
 
 
138 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  51.09 
 
 
138 aa  152  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 
138 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  49.28 
 
 
139 aa  152  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  50.36 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  50.36 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  52.9 
 
 
144 aa  150  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  50.36 
 
 
150 aa  149  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  51.45 
 
 
138 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  51.82 
 
 
147 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  48.91 
 
 
140 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 
139 aa  148  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  57.14 
 
 
149 aa  148  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  50.36 
 
 
147 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  55.83 
 
 
151 aa  146  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  52.55 
 
 
136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  48.91 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  55 
 
 
146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 
140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  50.36 
 
 
136 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 
136 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  49.62 
 
 
142 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  50.36 
 
 
136 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  50.36 
 
 
136 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  50.36 
 
 
136 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  50.36 
 
 
136 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 
134 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  50.36 
 
 
136 aa  141  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  49.64 
 
 
136 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  51.88 
 
 
195 aa  140  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  46.43 
 
 
140 aa  140  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1486  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  49.64 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  49.29 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  48.53 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  47.79 
 
 
144 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  48.18 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  54.2 
 
 
139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  48.18 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  45 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  48.18 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  48.18 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  48.18 
 
 
136 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  45.65 
 
 
138 aa  137  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1045  hypothetical protein  44.53 
 
 
140 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  45.26 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3029  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.99639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  45.26 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  45.26 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00553  hypothetical protein  45.26 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0617  hypothetical protein  45.26 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  45.26 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  45.26 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0682  hypothetical protein  45.26 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
142 aa  133  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  48.44 
 
 
138 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  46.27 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  53.33 
 
 
127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  52.89 
 
 
127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  43.8 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  53.33 
 
 
127 aa  129  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  53.45 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  52.5 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  52.5 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  52.5 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  52.5 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  52.5 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  52.5 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  52.5 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0652  hypothetical protein  43.8 
 
 
137 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0711  hypothetical protein  43.8 
 
 
137 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276365  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0695  hypothetical protein  43.8 
 
 
137 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0329769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0638  hypothetical protein  43.07 
 
 
137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0757  hypothetical protein  43.07 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.733145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>