14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3387 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3387  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0845009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3490  hypothetical protein  49.8 
 
 
264 aa  240  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425617  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0097  hypothetical protein  49.58 
 
 
274 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1997  hypothetical protein  33.47 
 
 
241 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5006  hypothetical protein  31.36 
 
 
266 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06660  hypothetical protein  30.49 
 
 
265 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04425  hypothetical protein  31.51 
 
 
256 aa  102  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0522  hypothetical protein  26.42 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.582583  normal  0.0215931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0100  hypothetical protein  25.86 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1601  hypothetical protein  25.27 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.253838 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0146  hypothetical protein  24.11 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2274  hypothetical protein  27.46 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2893  hypothetical protein  22.54 
 
 
342 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.213192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1589  hypothetical protein  28.47 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>