46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2835 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2835  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
202 aa  414  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4807  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.69 
 
 
207 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6421  hypothetical protein  31.46 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00995636  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1235  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.05 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000509525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0124  helix-turn-helix, Fis-type  27.57 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.490683  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2933  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.4 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.41 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957442  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0274  redoxin  28.73 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5059  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.09 
 
 
223 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5164  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.58 
 
 
223 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1677  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.16 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.44 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0807  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  28.41 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5141  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.44 
 
 
226 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301686  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2665  hypothetical protein  22.54 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.62 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.186227  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2991  redoxin domain-containing protein  21.84 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3516  AhpC/Tsa family protein, selenocysteine-containing  24.86 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000205583  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.75 
 
 
226 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0709659  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2811  redoxin domain-containing protein  21.26 
 
 
215 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2894  redoxin domain-containing protein  21.26 
 
 
215 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1381  hypothetical protein  19.54 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1027  bacterioferritin comigratory protein, putative  29.91 
 
 
163 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2053  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.62 
 
 
157 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0949  redoxin domain-containing protein  21.08 
 
 
222 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1755  redoxin  26.21 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5154  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.59 
 
 
217 aa  44.7  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176313  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0066  AhpC/Tsa family protein, selenocysteine-containing  25.36 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1094  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.64 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.606072  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2230  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.4 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  18.93 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2262  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.93 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3092  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.69 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2365  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.82 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.69 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.025666 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2997  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.57 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.69 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73798  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3245  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.69 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4300  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.46 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2815  redoxin domain-containing protein  25.37 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1704  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.42 
 
 
162 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178423  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5324  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.41 
 
 
226 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236507  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.27 
 
 
149 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0352  redoxin  26.55 
 
 
214 aa  42  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5433  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.09 
 
 
208 aa  41.2  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1818  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.76 
 
 
196 aa  41.2  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>