24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2778 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2778  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
327 aa  681    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2577  hypothetical protein  52.11 
 
 
356 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  39.86 
 
 
3301 aa  238  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 
856 aa  225  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3985  hypothetical protein  38.7 
 
 
527 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  35.91 
 
 
867 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0150  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
316 aa  183  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2581  hypothetical protein  32.19 
 
 
335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0517  hypothetical protein  36.01 
 
 
339 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1329  hypothetical protein  35.19 
 
 
450 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5781  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.820711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2780  hypothetical protein  26.07 
 
 
317 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0423  hypothetical protein  24.8 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  27.78 
 
 
916 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3366  hypothetical protein  23.72 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0934  hypothetical protein  22.71 
 
 
573 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  22.55 
 
 
1562 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1551  hypothetical protein  21.43 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983382  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3527  hypothetical Glycosyltransferase  23.02 
 
 
689 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1704  hypothetical Glycosyltransferase  23.02 
 
 
689 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.663936  hitchhiker  0.0000000000000460309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0250  hypothetical protein  21.84 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  24.5 
 
 
1364 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1771  hypothetical protein  19.7 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0716326  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0673  putative glycosyltransferase  21.7 
 
 
327 aa  42.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.353586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>