14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1720 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1720  HEPN domain protein  100 
 
 		 305 aa  635    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0837  DNA polymerase beta domain protein region  68.66 
 
 		 286 aa  401  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5246  DNA polymerase beta domain protein region  65.85 
 
 		 284 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4231  nucleotidyltransferase  34.68 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00450243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2595  hypothetical protein  33.66 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3200  hypothetical protein  34.67 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2515  hypothetical protein  33.12 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6110  DNA polymerase beta subunit  34.45 
 
 		 303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  32.24 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5174  HEPN domain-containing protein  30.23 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0411727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3627  hypothetical protein  21.74 
 
 		 545 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0267777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0174  hypothetical protein  27.94 
 
 		 161 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582709  normal  0.551801 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3647  hypothetical protein  26.62 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3676  hypothetical protein  25.97 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>