40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1553 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1553  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  457  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3446  hypothetical protein  49.77 
 
 
220 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3204  hypothetical protein  47.95 
 
 
227 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0529  hypothetical protein  47.71 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0164114  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0067  hypothetical protein  47.27 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5568  hypothetical protein  49.54 
 
 
221 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.982925  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0909  hypothetical protein  45 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2658  protein of unknown function DUF1061  29.82 
 
 
236 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2988  hypothetical protein  28.79 
 
 
235 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000939837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3313  hypothetical protein  28.79 
 
 
235 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3091  hypothetical protein  28.79 
 
 
235 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2734  hypothetical protein  30.36 
 
 
227 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000970803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3273  hypothetical protein  28.79 
 
 
235 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3335  hypothetical protein  29.17 
 
 
229 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694909  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0294  protein of unknown function DUF1061  30.04 
 
 
234 aa  101  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1969  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.86972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3298  hypothetical protein  27.78 
 
 
235 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.910615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2986  hypothetical protein  30.22 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000288545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2660  hypothetical protein  30.8 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2732  hypothetical protein  29.91 
 
 
227 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2683  hypothetical protein  29.91 
 
 
227 aa  99  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000553491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2940  hypothetical protein  29.91 
 
 
227 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6684100000000001e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2941  hypothetical protein  29.91 
 
 
227 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000572479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3305  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1043  hypothetical protein  27.78 
 
 
235 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3037  hypothetical protein  27.6 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.972219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2946  hypothetical protein  29.46 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0505  hypothetical protein  34.74 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459483  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2299  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0222691  hitchhiker  5.32762e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2978  hypothetical protein  29.78 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000992399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3386  protein of unknown function DUF1061  23.77 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  30.77 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  25.13 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  23.66 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  23.56 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  26.79 
 
 
218 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  27.08 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  24.49 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  25.91 
 
 
227 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  22.84 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>