32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1319 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1319  metallophosphoesterase  100 
 
 
406 aa  844    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5228  metallophosphoesterase  64.4 
 
 
369 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0838269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0846  metallophosphoesterase  55.86 
 
 
371 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.442383  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3690  metallophosphoesterase  48.52 
 
 
377 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.93963  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1801  metallophosphoesterase  28.27 
 
 
517 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.050773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6679  hypothetical protein  27.05 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207997  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6374  metallophosphoesterase  26.7 
 
 
512 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  28.74 
 
 
701 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2154  metallophosphoesterase  25.4 
 
 
1019 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000106564  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  25.61 
 
 
521 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  27.71 
 
 
686 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  25.6 
 
 
473 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2983  predicted protein  26.87 
 
 
312 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  27.07 
 
 
1139 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3941  hypothetical protein  22.73 
 
 
579 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  31.22 
 
 
774 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1254  hypothetical protein  22 
 
 
680 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  29.46 
 
 
442 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12597  hypothetical protein  24.07 
 
 
529 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1019  phosphohydrolase  24.03 
 
 
410 aa  47  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  23.64 
 
 
468 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  28.77 
 
 
326 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  26.47 
 
 
265 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  23.7 
 
 
717 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2351  metallophosphoesterase  29.93 
 
 
251 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.908698  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  30.7 
 
 
274 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1170  metallophosphoesterase  27.54 
 
 
300 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.936707  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0208  metallophosphoesterase  24.37 
 
 
270 aa  43.5  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2336  hypothetical protein  24.67 
 
 
590 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2179  hypothetical protein  24.67 
 
 
590 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.92082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5306  metallophosphoesterase  22.14 
 
 
295 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.15 
 
 
274 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>