27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0438 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0438  putative esterase  100 
 
 
237 aa  495  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1340  putative esterase  60.34 
 
 
234 aa  312  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.524474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5938  putative esterase  53.19 
 
 
235 aa  267  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4003  putative esterase  35.02 
 
 
239 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1799  putative esterase  35.71 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.938464  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2618  putative esterase  34.96 
 
 
239 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0203  putative esterase  34.57 
 
 
249 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2168  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2439  hypothetical protein  34.15 
 
 
242 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4768  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0307  putative esterase  34.3 
 
 
241 aa  154  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.268113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1747  hypothetical protein  33.74 
 
 
242 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.672551  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2519  putative esterase  33.61 
 
 
242 aa  151  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.923946  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2122  hypothetical protein  34.16 
 
 
242 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0876  putative esterase  31.69 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.942655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0053  putative esterase  34.89 
 
 
238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177821  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1643  hypothetical protein  32.39 
 
 
250 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.64306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0220  hypothetical protein  31.82 
 
 
242 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3264  putative esterase  28.63 
 
 
248 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678307  hitchhiker  0.000491614 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0423  putative esterase  27.52 
 
 
336 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  27.22 
 
 
267 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5450  putative esterase  32.88 
 
 
593 aa  45.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3275  PHA synthase subunit PhaC  24.68 
 
 
352 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.066946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1341  putative esterase  26.83 
 
 
279 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4335  putative esterase  28.12 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4275  glycoside hydrolase family 13 protein  29.06 
 
 
389 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4248  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.06 
 
 
389 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>