14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0057 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0057  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0039  hypothetical protein  52.26 
 
 
282 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3967  hypothetical protein  54.14 
 
 
285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0252108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1071  hypothetical protein  52.27 
 
 
278 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0123095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3905  prophage antirepressor  48.47 
 
 
284 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3402  prophage antirepressor  49.81 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1527  hypothetical protein  45.45 
 
 
288 aa  235  7e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.835247  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1001  hypothetical protein  45.62 
 
 
271 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1275  hypothetical protein  43.66 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1447  prophage antirepressor  43.82 
 
 
285 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1152  prophage antirepressor  44.62 
 
 
294 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0642  hypothetical protein  45.56 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209985  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0531  hypothetical protein  40.62 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.04 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>