23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1834 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1834  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1286    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2077  hypothetical protein  34.7 
 
 		 982 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1399  Ribosomal small subunit Rsm22  48.74 
 
 		 973 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  39.73 
 
 		 576 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0081  hypothetical protein  28.86 
 
 		 462 aa  77  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  46.3 
 
 		 336 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  35.96 
 
 		 322 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  38.27 
 
 		 323 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  36.99 
 
 		 325 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 321 aa  52.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  42.59 
 
 		 326 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  46.3 
 
 		 321 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3860  Ribosomal small subunit Rsm22  43.64 
 
 		 327 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.713494  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  41.51 
 
 		 354 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 356 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  35.8 
 
 		 321 aa  47.8  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  35.8 
 
 		 321 aa  47.8  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  42.59 
 
 		 318 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  35.71 
 
 		 348 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2135  Ribosomal small subunit Rsm22  37.1 
 
 		 332 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2411  methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 340 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321714  normal  0.120209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>