37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1489 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  32.17 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  23.44 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  33.62 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  31.91 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  33.62 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  24.84 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  31.15 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  34.51 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  35.48 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  25.75 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  25.77 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  31.13 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  30.08 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  24.24 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  27.05 
 
 		 238 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  27.03 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  36.11 
 
 		 224 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  25.47 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  25 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  24.03 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  27.56 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  33.9 
 
 		 438 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  26.32 
 
 		 227 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  33.9 
 
 		 408 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  38.71 
 
 		 430 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  23.66 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  29.45 
 
 		 391 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4045  Ion transport 2 domain protein  46 
 
 		 119 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  27.64 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  42.11 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  28.83 
 
 		 391 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  31.13 
 
 		 235 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  42.11 
 
 		 276 aa  42  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>