15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0949 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0949  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  54.19 
 
 
276 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  54.49 
 
 
313 aa  175  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  50.97 
 
 
313 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  27.21 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  30.25 
 
 
188 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  25.15 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  27.13 
 
 
190 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  30.46 
 
 
205 aa  48.5  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  25.15 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  24.55 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  29.94 
 
 
190 aa  45.1  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  28 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  27.78 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  27.66 
 
 
211 aa  42  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>