39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2454 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  100 
 
 		 155 aa  300  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  42.58 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  45.75 
 
 		 159 aa  123  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  40 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  38.71 
 
 		 186 aa  94.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  32.68 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  32.26 
 
 		 193 aa  73.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  28.76 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  26.8 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  26.14 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2259  colicin V production protein  30.43 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00673398  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  32.3 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  31.71 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  29.11 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  25.95 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  31.06 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  30.91 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  22.97 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  30 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2227  Colicin V production protein  28.66 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630839  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  26.52 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2737  colicin V production protein  28.66 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  28.57 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  25 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  26.09 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  27.74 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  24.36 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  29.93 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  25 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  27.27 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  26.12 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  26.92 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  31.58 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  25.34 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  29.79 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0733  Colicin V production protein  31.61 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.018844  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  23.74 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  24.32 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  23.46 
 
 		 169 aa  40.4  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>