58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1889 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1889  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family  100 
 
 
271 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.105757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2341  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  51.48 
 
 
276 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.696537  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2128  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family  54.31 
 
 
273 aa  259  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2545  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  48.06 
 
 
275 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00100234  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2053  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  47.57 
 
 
274 aa  255  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.483164  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1229  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  47.19 
 
 
271 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000280677  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1688  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  47.19 
 
 
271 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570883  decreased coverage  0.000939338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2188  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  47.19 
 
 
271 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1078  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  46.82 
 
 
271 aa  248  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000130246  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2733  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  46.82 
 
 
271 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000138935  normal  0.573407 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1694  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  46.82 
 
 
271 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000333785  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2145  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  45.69 
 
 
271 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00208109  normal  0.0800386 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2203  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  45.69 
 
 
271 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0526685  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1133  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  45.69 
 
 
271 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183774  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2149  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  45.32 
 
 
271 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0107149  normal  0.0107752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1254  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  45.26 
 
 
278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0460997  normal  0.891448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2604  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  45.52 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2568  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  43.75 
 
 
266 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0146669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2582  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  43.75 
 
 
266 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00833536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2575  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  43.75 
 
 
266 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00380235  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1820  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  42.29 
 
 
260 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00552439  normal  0.470118 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02159  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  36.63 
 
 
269 aa  158  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510436  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0772  HAD family hydrolase YedP  34.73 
 
 
269 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2602  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  37.36 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370831  normal  0.0340144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2848  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.3 
 
 
286 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3208  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.94 
 
 
277 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0508  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  36.53 
 
 
287 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0421  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.38 
 
 
259 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00171889  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1773  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.72 
 
 
273 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2162  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.4 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0501  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  38.79 
 
 
277 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0736  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.96 
 
 
272 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2501  HAD family hydrolase YedP  31.7 
 
 
267 aa  126  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10431  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.59 
 
 
266 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.265902  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0839  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  27.55 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00773079  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08961  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  27.55 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.192004  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08981  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  27.55 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.67778  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2605  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.42 
 
 
263 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2242  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.65 
 
 
263 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09151  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.87 
 
 
266 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0247  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30 
 
 
269 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.344605  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1144  HAD-superfamily hydrolase  29.51 
 
 
694 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.191056  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1363  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  30.33 
 
 
694 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0011007  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06761  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  28.45 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.41911 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1174  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  29.51 
 
 
694 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0053101  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  24.89 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  24.38 
 
 
272 aa  52.8  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  22.5 
 
 
262 aa  52.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  28.37 
 
 
232 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0834  HAD superfamily hydrolase  26.27 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  25.42 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  21.46 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  27.31 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  22.07 
 
 
232 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  22.43 
 
 
226 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  24.43 
 
 
270 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1811  Cof-like hydrolase  30.88 
 
 
276 aa  42.4  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  19.59 
 
 
257 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>