More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1234 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1234  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
239 aa  498  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.399981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2768  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  85.36 
 
 
239 aa  421  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00262  predicted oxidoreductase  77.82 
 
 
239 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3299  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  77.82 
 
 
239 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2677  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  77.82 
 
 
239 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0259  cysteine-rich domain protein  77.41 
 
 
239 aa  401  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00266  hypothetical protein  77.82 
 
 
239 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0359  hypothetical protein  77.41 
 
 
239 aa  401  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0359  cysteine-rich domain protein  77.82 
 
 
239 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.477523 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0321  hypothetical protein  77.41 
 
 
239 aa  401  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0338  hypothetical protein  77.41 
 
 
239 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3316  hypothetical protein  77.41 
 
 
239 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1749  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  78.24 
 
 
239 aa  394  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0856492  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0709  hypothetical protein  64.73 
 
 
243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.162619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.21 
 
 
238 aa  254  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.27 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  50.21 
 
 
239 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  50.21 
 
 
239 aa  250  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  49.79 
 
 
239 aa  247  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  49.79 
 
 
239 aa  248  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  49.79 
 
 
239 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  49.79 
 
 
239 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  49.79 
 
 
239 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  49.79 
 
 
239 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  49.79 
 
 
239 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  49.79 
 
 
239 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  49.79 
 
 
239 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.84 
 
 
248 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  44.73 
 
 
242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  44.73 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  44.73 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  43.04 
 
 
245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  44.3 
 
 
242 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.77 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  43.46 
 
 
256 aa  205  6e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  40.6 
 
 
260 aa  201  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0375  hypothetical protein  41.84 
 
 
289 aa  200  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000724873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  44.26 
 
 
266 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.02 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  43.22 
 
 
263 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  45.57 
 
 
268 aa  198  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  45.15 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  44.96 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  45.15 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  45.15 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  45.15 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  45.15 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.49 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41 
 
 
246 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.7 
 
 
259 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  42.86 
 
 
241 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5226  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.08 
 
 
249 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  41.53 
 
 
274 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.34 
 
 
239 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  43.1 
 
 
234 aa  191  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3730  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.67 
 
 
249 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542099  normal  0.363647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.26 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102494  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.67 
 
 
249 aa  188  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92586  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.83 
 
 
244 aa  188  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  39.75 
 
 
261 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3704  hypothetical protein  40 
 
 
246 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  42.68 
 
 
256 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05530  Fe-S oxidoreductase  40.08 
 
 
248 aa  186  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  42.37 
 
 
270 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  42.02 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.02 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.6 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05130  Fe-S oxidoreductase  41.22 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3104  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.43 
 
 
267 aa  181  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2709  hypothetical protein  38.91 
 
 
248 aa  181  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  0.129266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  40.34 
 
 
241 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.83 
 
 
247 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.98 
 
 
265 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.37 
 
 
248 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  44.07 
 
 
260 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  38.43 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  37.24 
 
 
242 aa  179  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  37.7 
 
 
250 aa  177  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.55 
 
 
245 aa  177  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4766  hypothetical protein  41.32 
 
 
251 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4385  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.32 
 
 
251 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4472  hypothetical protein  41.32 
 
 
251 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.783879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  36.29 
 
 
246 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.91 
 
 
270 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  42.98 
 
 
265 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  40.08 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04070  Fe-S oxidoreductase  39 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0880878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.7 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  39.92 
 
 
240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  39.92 
 
 
263 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  39.92 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  39.92 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  39.92 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  39.92 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  39.92 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.34 
 
 
240 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0891  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.78 
 
 
264 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2001  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.92 
 
 
237 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000985814  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2425  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.24 
 
 
244 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00338747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  39.5 
 
 
240 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>