26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3193 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3193  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  56.19 
 
 
195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0909  hypothetical protein  52.91 
 
 
203 aa  207  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3394  hypothetical protein  50.52 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0986  hypothetical protein  44.92 
 
 
202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.810424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3236  hypothetical protein  45.99 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723853  normal  0.49379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1038  hypothetical protein  45.99 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3819  putative prepilin peptidase dependent protein  51.35 
 
 
192 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21629  normal  0.274461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3267  hypothetical protein  37.43 
 
 
187 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217018  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3145  hypothetical protein  32.28 
 
 
187 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3325  hypothetical protein  32.28 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0234254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3211  hypothetical protein  31.75 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0227647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4090  hypothetical protein  32.09 
 
 
187 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171812  normal  0.628463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3145  hypothetical protein  32.09 
 
 
187 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0305853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2972  hypothetical protein  32.09 
 
 
187 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157774  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3037  hypothetical protein  32.09 
 
 
187 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0890  hypothetical protein  32.09 
 
 
187 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2971  hypothetical protein  32.09 
 
 
187 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0866  prepilin peptidase dependent protein B  32.09 
 
 
187 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02673  hypothetical protein  31.55 
 
 
187 aa  104  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.315688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02634  hypothetical protein  31.55 
 
 
187 aa  104  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282625  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3162  hypothetical protein  30.73 
 
 
174 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.371591  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3225  hypothetical protein  30.73 
 
 
174 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0159896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3166  prepilin-type cleavage/methylation-like  32.93 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03019  putative prepilin peptidase dependent protein  27.04 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  26.8 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.661552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>