43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2181 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2181  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 120 aa  247  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1999  hypothetical protein  67.57 
 
 		 134 aa  163  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1940  protein of unknown function UPF0153  67.24 
 
 		 120 aa  158  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1595  ferredoxin  66.36 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1413  hypothetical protein  66.36 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1923  ferredoxin  66.36 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1860  ferredoxin  66.36 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1866  ferredoxin  66.36 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354364  normal  0.828444 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3316  protein of unknown function UPF0153  59.09 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00247  predicted ferredoxin  59.09 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00250  hypothetical protein  59.09 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3331  hypothetical protein  59.09 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.331076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0398  protein of unknown function UPF0153  59.29 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0856  hypothetical protein  54.55 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0842  hypothetical protein  53.64 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0802023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0819  hypothetical protein  53.64 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0818071  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4370  hypothetical protein  54.55 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1253  hypothetical protein  51.82 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.579212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22700  putative ferredoxin  53.77 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.025963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1827  hypothetical protein  48.7 
 
 		 123 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.889307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2001  protein of unknown function UPF0153  52.38 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0169  protein of unknown function UPF0153  48.62 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03952  ferredoxin  45.45 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1008  ferredoxin  46.79 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0878906  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0886  hypothetical protein  46.79 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1159  hypothetical protein  48.57 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15570  hypothetical protein  51.72 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1450  protein of unknown function UPF0153  46.6 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2174  hypothetical protein  43.81 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2436  protein of unknown function UPF0153  44.76 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1917  hypothetical protein  52.05 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2884  hypothetical protein  45.37 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000156715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3004  hypothetical protein  40.91 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2432  protein of unknown function UPF0153  40.54 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7105  hypothetical protein  38.6 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3596  hypothetical protein  39.66 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1919  protein of unknown function UPF0153  38.32 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1698  hypothetical protein  37.84 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2209  hypothetical protein  34.91 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3008  hypothetical protein  36.54 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0093  hypothetical protein  36.05 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5429  protein of unknown function UPF0153  32.38 
 
 		 106 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0259414  hitchhiker  0.00694306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0025  hypothetical protein  49.02 
 
 		 104 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0233008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>