41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2432 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2432  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 116 aa  243  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3004  hypothetical protein  98.28 
 
 		 114 aa  234  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1159  hypothetical protein  45.71 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2174  hypothetical protein  45.63 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1450  protein of unknown function UPF0153  46.39 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2436  protein of unknown function UPF0153  45 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0842  hypothetical protein  43.59 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0802023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0819  hypothetical protein  43.59 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0818071  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1253  hypothetical protein  43.27 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.579212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4370  hypothetical protein  43.59 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0856  hypothetical protein  43.59 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1827  hypothetical protein  43.52 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.889307 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0398  protein of unknown function UPF0153  40.57 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1940  protein of unknown function UPF0153  40.18 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22700  putative ferredoxin  45.24 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.025963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2181  protein of unknown function UPF0153  40.54 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1923  ferredoxin  38.18 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1860  ferredoxin  38.18 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1595  ferredoxin  38.18 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1866  ferredoxin  37.14 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354364  normal  0.828444 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3316  protein of unknown function UPF0153  35.85 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00247  predicted ferredoxin  35.85 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3331  hypothetical protein  35.85 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.331076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00250  hypothetical protein  35.85 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03952  ferredoxin  39.29 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1413  hypothetical protein  37.27 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0169  protein of unknown function UPF0153  40 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1999  hypothetical protein  36.19 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2884  hypothetical protein  38.24 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000156715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0886  hypothetical protein  36.36 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2001  protein of unknown function UPF0153  33.01 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1008  ferredoxin  36.36 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0878906  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1247  hypothetical protein  31.68 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15570  hypothetical protein  40.91 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1365  hypothetical protein  32.99 
 
 		 361 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1919  protein of unknown function UPF0153  31.78 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1917  hypothetical protein  41.07 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  36.11 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1698  hypothetical protein  30.77 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3596  hypothetical protein  32.04 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3008  hypothetical protein  33.68 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>