41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0819 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0819  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  263  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0818071  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0842  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  263  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0802023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0856  hypothetical protein  97.64 
 
 		 127 aa  256  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4370  hypothetical protein  96.85 
 
 		 127 aa  255  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1827  hypothetical protein  72.32 
 
 		 123 aa  174  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.889307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1253  hypothetical protein  68.07 
 
 		 117 aa  173  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.579212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22700  putative ferredoxin  66.67 
 
 		 123 aa  147  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.025963 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3316  protein of unknown function UPF0153  55.96 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00247  predicted ferredoxin  55.96 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00250  hypothetical protein  55.96 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3331  hypothetical protein  55.96 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.331076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2181  protein of unknown function UPF0153  53.64 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1940  protein of unknown function UPF0153  56.6 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1866  ferredoxin  53.21 
 
 		 134 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354364  normal  0.828444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0398  protein of unknown function UPF0153  52.94 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1999  hypothetical protein  52.38 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2001  protein of unknown function UPF0153  50 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1595  ferredoxin  53.21 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1413  hypothetical protein  53.21 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1923  ferredoxin  53.21 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1860  ferredoxin  53.21 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15570  hypothetical protein  60.92 
 
 		 105 aa  114  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0169  protein of unknown function UPF0153  52.34 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1917  hypothetical protein  61.33 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2436  protein of unknown function UPF0153  44.95 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1159  hypothetical protein  46.67 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0886  hypothetical protein  44.86 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1008  ferredoxin  44.86 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0878906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03952  ferredoxin  43.93 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2432  protein of unknown function UPF0153  43.59 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1450  protein of unknown function UPF0153  45.63 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3004  hypothetical protein  41.88 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2174  hypothetical protein  40.95 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2884  hypothetical protein  44.35 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000156715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1919  protein of unknown function UPF0153  39.62 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3596  hypothetical protein  34.86 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1698  hypothetical protein  33.03 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2209  hypothetical protein  33.64 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7105  hypothetical protein  32.73 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1247  hypothetical protein  30.7 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>