42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22700 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_22700  putative ferredoxin  100 
 
 		 123 aa  253  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.025963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1827  hypothetical protein  74.8 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.889307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4370  hypothetical protein  67.8 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0856  hypothetical protein  67.8 
 
 		 127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0819  hypothetical protein  66.95 
 
 		 127 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0818071  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0842  hypothetical protein  66.95 
 
 		 127 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0802023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1253  hypothetical protein  63.96 
 
 		 117 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.579212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1917  hypothetical protein  92.31 
 
 		 91 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15570  hypothetical protein  73.33 
 
 		 105 aa  134  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2181  protein of unknown function UPF0153  54.31 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3331  hypothetical protein  57.8 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.331076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00250  hypothetical protein  57.8 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00247  predicted ferredoxin  57.8 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3316  protein of unknown function UPF0153  57.8 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1940  protein of unknown function UPF0153  54.05 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1999  hypothetical protein  50.43 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1866  ferredoxin  51.72 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354364  normal  0.828444 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1923  ferredoxin  51.72 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1860  ferredoxin  51.72 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1413  hypothetical protein  51.72 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1595  ferredoxin  51.72 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0398  protein of unknown function UPF0153  53.57 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0169  protein of unknown function UPF0153  48.6 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2001  protein of unknown function UPF0153  48.11 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03952  ferredoxin  43.93 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2436  protein of unknown function UPF0153  47.71 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0886  hypothetical protein  44.86 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1008  ferredoxin  44.86 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0878906  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1159  hypothetical protein  46.67 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2884  hypothetical protein  46.09 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000156715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2432  protein of unknown function UPF0153  43.93 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2174  hypothetical protein  40.37 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1450  protein of unknown function UPF0153  41.75 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3004  hypothetical protein  43.4 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3596  hypothetical protein  34.51 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1698  hypothetical protein  34.51 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1919  protein of unknown function UPF0153  30.28 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2209  hypothetical protein  27.27 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1365  hypothetical protein  33.68 
 
 		 361 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1247  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7105  hypothetical protein  33.94 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5429  protein of unknown function UPF0153  34.21 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0259414  hitchhiker  0.00694306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>