30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5429 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5429  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 106 aa  209  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0259414  hitchhiker  0.00694306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2209  hypothetical protein  61.8 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0093  hypothetical protein  56.67 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3596  hypothetical protein  55.45 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1698  hypothetical protein  56.38 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1919  protein of unknown function UPF0153  53.47 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7105  hypothetical protein  54.17 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1247  hypothetical protein  53.06 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0028  protein of unknown function UPF0153  55.42 
 
 		 100 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0025  hypothetical protein  55.29 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0233008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3008  hypothetical protein  40.86 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1365  hypothetical protein  43.43 
 
 		 361 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2436  protein of unknown function UPF0153  39.36 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1159  hypothetical protein  36.63 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1450  protein of unknown function UPF0153  34.69 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3316  protein of unknown function UPF0153  34.23 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00250  hypothetical protein  34.23 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3331  hypothetical protein  34.23 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.331076  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00247  predicted ferredoxin  34.23 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2174  hypothetical protein  37.76 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1999  hypothetical protein  31.19 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0398  protein of unknown function UPF0153  36.19 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1595  ferredoxin  33.63 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1413  hypothetical protein  33.63 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1866  ferredoxin  33.63 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354364  normal  0.828444 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1923  ferredoxin  33.63 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1860  ferredoxin  33.63 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2181  protein of unknown function UPF0153  32.38 
 
 		 120 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1940  protein of unknown function UPF0153  31.9 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2884  hypothetical protein  35.8 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000156715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>