28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0028 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0028  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 100 aa  196  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0025  hypothetical protein  90.62 
 
 		 104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0233008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7105  hypothetical protein  65.59 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2209  hypothetical protein  64.04 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1919  protein of unknown function UPF0153  64.44 
 
 		 110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54208  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0093  hypothetical protein  64.21 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1698  hypothetical protein  62.77 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3596  hypothetical protein  64.44 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5429  protein of unknown function UPF0153  54 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0259414  hitchhiker  0.00694306 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1247  hypothetical protein  55.34 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3008  hypothetical protein  45.05 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1159  hypothetical protein  41 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1450  protein of unknown function UPF0153  39.18 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1365  hypothetical protein  35.48 
 
 		 361 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2436  protein of unknown function UPF0153  38.14 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2181  protein of unknown function UPF0153  37.14 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1999  hypothetical protein  31.07 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1923  ferredoxin  35.24 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135966 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1866  ferredoxin  35.24 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354364  normal  0.828444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1413  hypothetical protein  35.24 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1595  ferredoxin  35.24 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1860  ferredoxin  35.24 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1940  protein of unknown function UPF0153  37.14 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0398  protein of unknown function UPF0153  34.95 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1253  hypothetical protein  34.62 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.579212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2001  protein of unknown function UPF0153  33.77 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4370  hypothetical protein  34.31 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>