26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0093 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0093  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  218  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1247  hypothetical protein  64.13 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7105  hypothetical protein  62.07 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5429  protein of unknown function UPF0153  56.67 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0259414  hitchhiker  0.00694306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1698  hypothetical protein  57.14 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1919  protein of unknown function UPF0153  53.54 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3596  hypothetical protein  52.53 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2209  hypothetical protein  51.02 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0028  protein of unknown function UPF0153  64.1 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0025  hypothetical protein  61.29 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0233008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3008  hypothetical protein  40.91 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1365  hypothetical protein  39.58 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2174  hypothetical protein  36.27 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1450  protein of unknown function UPF0153  37.5 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1159  hypothetical protein  40.43 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0398  protein of unknown function UPF0153  39.08 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2436  protein of unknown function UPF0153  34.38 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1999  hypothetical protein  32.38 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1866  ferredoxin  36.25 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354364  normal  0.828444 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1940  protein of unknown function UPF0153  34.12 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1923  ferredoxin  36.25 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1595  ferredoxin  36.25 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1860  ferredoxin  36.25 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2181  protein of unknown function UPF0153  36.05 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1413  hypothetical protein  35 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2884  hypothetical protein  35 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000156715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>