21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2599 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0447  TonB dependent receptor domain-containing protein  48.81 
 
 		 841 aa  754    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000427237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2599  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 840 aa  1715    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0846  TonB-dependent receptor, plug  31.94 
 
 		 879 aa  342  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1224  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 908 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.735079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1947  hypothetical protein  29.84 
 
 		 859 aa  249  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.205768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 935 aa  227  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  26.37 
 
 		 862 aa  218  4e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3287  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 856 aa  212  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550182  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0932  putative TonB dependent receptor  26.93 
 
 		 859 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0760  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 867 aa  191  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1759  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 790 aa  179  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.949304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1685  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 790 aa  177  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2151  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 790 aa  177  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2162  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 790 aa  177  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2108  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 790 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347716  normal  0.376393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01466  hypothetical protein  26.22 
 
 		 790 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01453  predicted porin protein  26.22 
 
 		 790 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1580  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 790 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1678  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 790 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 934 aa  163  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0894  hypothetical protein  25.52 
 
 		 488 aa  104  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>